Hồi 8g30 sáng thứ Ba, 16/9/2003, Tổng giáo phận Saigon long trọng tổ chức lễ giỗ giáp năm cho Đức Cố Hồng Y Phanxicô Xaviê Nguyễn Văn Thuận, nguyên Tổng Giám Mục Phó có quyền kế vị, tại Nhà thờ Chính Tòa Saigon. Đức Tổng Giám Mục Gioan Baotixita Phạm Minh Mẫn chủ sự thánh lễ đồng tế cùng với Đức cha Phụ Tá Giuse Vũ Duy Thống, Đức cha Micae Nguyễn Văn Diệp, nguyên GM Phó Vĩnh Long và hơn 130 cha dòng, triều, đông đảo các nam nữ tu sĩ và anh chị em giáo hữu. Hiện diện trong thánh lễ còn có một số thân nhân của Đức Cố HY.

Đoàn đồng tế từ cuối nhà thờ tiến lên, trước di ảnh của Đức Cố HY được đặt trang trọng trên cung thánh, dâng nhang tỏ lòng tôn kính đối với vị cha chung của giáo phận

Mở đầu thánh lễ, Đức TGM Gioan Baotixita gợi như sau:

“Hôm nay giáo triều Rôma tổ chưc lễ giỗ Đức HY Phanxicô Xaviê Nguyễn Văn Thuận tại nhà thờ Đức Mẹ Cầu Thang là nhà thờ hiệu tòa của Đức HY Phanxicô Xaviê. Trong tinh thần hiệp thông với Giáo Hội Rôma và trong tâm tình hiếu thảo đối với Thiên Chúa là Cha yêu thương đã ban cho giáo phận chúng ta một vị mục tử góp phần xây dựng Nước Thiên Chúa trong thành phố này, chúng ta hãy tạ ơn Thiên Chúa và cầu khẩn xin Thiên Chúa cho Đức HY cùng với Đức Giêsu Kitô đồng hành với chúng ta trong công cuộc Phúc Am hóa và xây dựng Nước Thiên Chúa là Nước Sự Sống Chân Thật và thánh thiện, Nước Yêu Thương và Bình An”.

Trong phần giảng thuyết, dựa vào ba bài đọc, Đức TGM chia sẻ với cộng đoàn dân Chúa:

“…Cầu nguyện cho người đã qua đời là thể hiện niềm tin vào mầu nhiệm đời sống hiệp thông trong Giáo Hội, đồng thời cũng la khơi dậy niềm tin vào Chúa Giêsu Kitô là Sự Sống lại và là Sự Sống của chúng ta. Niềm tin đó là cánh cửa mở ra cho chúng ta đi đến sự sống thật, sự sống dồi dào, sự sống muôn đời…

Phúc cho kẻ chết trong Chúa. Người được chết trong Chúa là kẻ đã sống trong Chúa, sống theo Chúa, sống vì Chúa. Những việc họ làm là những việc làm theo Lời Chúa dạy, phát xuất từ tình thương bác ái, và chúng tồn tại với họ….Cái chết trong Chúa cũng là cái chết giống như cái chết của Chúa Giêsu. Cái chết của Chúa Giêsu không những là cửa ngõ đưa vào cõi trường sinh, song còn là cái chết của hạt lúa giống, cái chết làm phát sinh sự sống dồi dào cho nhiều người khác, cho các thế hệ hậu sinh. Đối với Chúa Giêsu, cái chết của hạt lúa giống làm phát sinh sự sống không những là qui luật thiên nhiên, song còn là kế hoạch cứu độ theo thánh ý Thiên Chúa, cái chết đó có một vai tró thiết yếu trong lịch sử cứu độ. Nói đến vai trò lịch sử của cái chết đó làm tôi nhớ đến vai trò lịch sử của rừng cây mắm, rừng cây đước trên đất mũi Cà Mau như một minh họa cho cái chết làm phát sinh sự sống dồi dào cho các thế hệ hậu sinh….”

Hướng về ĐHY Phanxicô Xaviê, ĐTGM tiếp:” Ngoài việc cùng với tiền nhân để lại cho chúng ta thửa đất mầu mỡ, ĐHY Phanxicô Xaviê còn để lại cho chúng ta hạt giống đức tin, hạt giống niềm hy vọng, hạt giống tình thương bác ái Kitô giáo. Dự lễ tấn phong Hồng Y của Ngài tại Rôma làm cho tôi nhớ lại hoàn cảnh của thánh Phaolô: Tông đồ Phaolô đến Rôma với tư cách là tù nhân của đế quốc La Mã, thế nhưng với thời gian, Chúa Thánh Thần đã biến ông thành sứ gỉa Tin Mừng, thành chứng nhân đức tin cho chính dân Rôma cũng như cho lương dân trong các dân tộc. Thời gian lao tù khổ nhục, gian truân, trở thành thời gian Chúa Thánh Thần dùng để biến đổi ĐHY trở thành chứng nhân đức tin và chứng nhân niềm hy vọng cho Giáo Hội, cho chúng ta, trở nên chứng nhân tình thương của Thiên Chúa đối với dân Người. Công trình và hoa trái của Chúa Thánh Thần nơi ĐHY Phanxicô Xaviê vừa là lời nhắc nhở, vừa là lời khích lệ mỗi người chúng ta hãy để cho Chúa Thánh Thần dẫn dắt chúng ta trên con đường cứu độ và cũng là con đường yêu thương và phục vụ cho sự sống và phẩm gía con người.

Xin Thiên Chúa là Cha giầu lòng thươngxót, nhờ lời cầu bầu của ĐHY Phanxicô Xaviê, của các mục tử tiền nhân, ban thêm lòng tin cậy mến cho mỗi người, mỗi thành phần dân Chúa, biết noi gương các ngài cộng tác với Chúa Thánh Thần trong công cuộc Phúc Âm hóa và xây dựng Nước Thiên Chúa trên quê hương đất nước thân yêu này….

Sau thánh lễ, các nam nữ tu sĩ, đại chủng sinh, các thân nhân của ĐHY và toàn thể bà con giáo dân đã kính cẩn dâng những nén nhang nghi ngút tỏa hương thơm trước di ảnh mang phẩm phục Hồng Y của Ngài. Vào ban chiều cùng ngày, tại tất cả các nhà thờ, nhà nguyện trong toàn tổng giáo phận đều có thánh lễ cầu nguyện cho ĐHY Phanxicô Xaviê. Được biết, một linh mục Saigon đã lên đường qua Rôma và một linh mục gốc Huế tại Ý đã vế Saigon để dự lễ giỗ của ĐHY, đồng thời lễ giỗ này cũng được tổ chức tại nhà thờ chính tòa Hà Nội, nhà thờ Phủ Cam, Huế, nhà thờ chính tòa Nha Trang và nhiều nhà thờ khác tại quốc nội cũng như hải ngoại.